10x免疫组是什么?
10x单细胞测序在生命领域里面的应用价值已经不言而喻,在研究细胞发育、肿瘤异质性、细胞间互作通讯网络都有着许多成熟的方案。
但是,对于免疫的研究10X单细胞往往会有一点心有余而力不足,仅仅是研究细胞的表达量还是难以详细的刻画出组织内的免疫微环境。所以,10xgenomics在年推出了Chromium单细胞V(D)J解决方案,利用比较独特的建库方式可以对样本进行转录组测序的同时,也可以对样本内的T细胞与B细胞进行V(D)J区域测序。就相当于,同时获得了该细胞的表达信息与细胞的细胞V(D)J信息。通过V(D)J我们可以拼接出完整的CDR3系列,获得配对的VJ基因组成信息。
那么,基于免疫组库的信息我们可以做些什么呢?
基于对这些信息的进一步分析,我们可以:
(1)获得高扩增的克隆型序列以及了解不同克隆在不同样本间的流动与共享状况;
(2)辅助单细胞转录组的结果,更加可靠判断免疫细胞的分化轨迹;
(3)对不同样本、细胞亚群的TCR/BCR的重排特征有更深入的解析;
(4)对于不同的CDR3序列进行注释,寻找有效的CDR3序列。
单细胞免疫组产品介绍
但是拿到这些数据后,如何进行有效的数据过滤、挖掘、可视化相信很多科研人员都一筹莫展。但是!今天!派森诺生物将为您介绍我们新版的免疫组报告包含的分析内容,并且重要的是,报告还在持续不断的添加新的内容,只要您有改进的需求,我们将不断的更新优化中。
基础的比对信息、克隆型统计信息,序列信息通通包含,一眼就可以看到数据的详细信息。
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